Der Eisenbahnanschluss von Aubing geht auf das Bahngesetz vom 29.04.1869 zurück. Nach diversen Vorplanungen wurden dabei im großen Umfang die Grundlagen für nicht weniger als 22 neue Bahnstrecken in Bayern gelegt. Eine davon war die Strecke von München über Buchloe und Memmingen bis zur württembergischen Grenze. Hintergrund war der Gedanke, dass diese Linie später weiter gezogen bis an den Bodensee und Rhein größeren wirtschaftlichen und militärischen Nutzen bringen würde.

Die Bauoberleitung hatte dabei der königliche Eisenbahnbaudirektor Karl von Dyck. Der Deutsch-Französische Krieg war gerade erst beendet, als der (vorerst) eingleisige Bau im Sommer 1871 begonnen wurde. Zuvor hatte sich durch entsprechenden Grunderwerb die Bahn vorausschauend bereits die Grundlage für einen späteren zweigleisigen Ausbau schon gesichert. Nach einer Kosten- und Nutzungsanalyse war auch – neben Fürstenfeldbruck, Grafrath, Türkenfeld, Schwabhausen, Epfenhausen (als Sammelbahnhof für mehrere Gemeinden) und Kaufering – eine Bahnhofsstation für Aubing vorgesehen. 1872 begann man mit dem Bau und ein Jahr später erfolgte die Fertigstellung. Alle Bahngebäude entlang der Trasse waren nach einem Schema geplant und ausgeführt. Man konnte dadurch Planungszeit gewinnen und die Baukosten besser kalkulieren. Damit war auch eine Einheitlichkeit der Gebäude gegeben. Als Architekt war Georg Friedrich Seidel verantwortlich. Auch der Pasinger Bahnhof, der zeitgleich entstand, ist ein Werk von ihm.